CWL workflow on Toil with Univa Grid Engine
ゲノム解析に限らず、データ解析は1つのソフトウェアを実行して終わりということはまずありません。前処理からクオリティチェック、フィルタリング、1次解析、2次解析とワークフローを実行していき最後に目的の結果を可視化するという … “CWL workflow on Toil with Univa Grid Engine”の続きを読む
ゲノム解析に限らず、データ解析は1つのソフトウェアを実行して終わりということはまずありません。前処理からクオリティチェック、フィルタリング、1次解析、2次解析とワークフローを実行していき最後に目的の結果を可視化するという … “CWL workflow on Toil with Univa Grid Engine”の続きを読む
概要 Univa Grid Engine(以下UGE)の8.4.0以降のバージョンではUGEはDockerに対応しています。 とは言っても、正直言ってこれが意味するところはすぐにはピンと来ないかもしれません。 それは、対 … “Univa Grid Engine : DockerをUGEで管理する”の続きを読む
GPGPUのリソース管理について CPUの場合、どのコアが使われるのかのスケジューリングはkernelによって行われるため ジョブスケジューラーは使用コア数・空きコア数などの数を管理するだけでリソースが適切に配分されます … “Univa Grid Engine : GPGPUのリソース管理(RSMAP)”の続きを読む