NABE

次世代シーケンスデータ解析標準システム

Takeru for Sequencer V

Takeru: Beowulf Cluster Reference System
Takeru for Sequencerイメージ図

NGSデータ解析ソフトウェア構築済み

オープンソースで公開されているものを中心に、シーケンサーメーカーの提供するツールや有力な商用ソフトウェアも含めて設定・構築済みの状態で導入できるため、多様なデータ解析手法を試すことができます。

ソフトウェア詳細

データ解析環境構築

優れた信頼性のサーバーやストレージを構成するだけでなく、共同研究先や出張先からの遠隔アクセス設定、シーケンサー設置場所と研究室が離れている場合のネットワーク設定など、シーケンサー周りのIT環境全般を整備できます。

構築例

ワンストップサポート

解析アプリケーションの追加構築や不具合発生時の問題切り分けなど、ハードウェアおよびソフトウェアについてワンストップにて、プロジェクト期間中を通してサポートを得られます。

サポート詳細

仕様

ヘッドノードとなるRAIDサーバーに4つの計算ノードで構成されるクラスター構成例、およびヘッドノードに計算ノード2台を加えたベーシック構成例です。オプションのGPUノードも含め、ご希望やご予算に応じて構成の追加・変更が可能です。

Takeru for Sequencer V 構成仕様例

Takeru for Sequencer V 構成仕様例のモデル図
Cluster head node兼RAID server(1台) ※1
CPU Intel 16-core Xeon Gold 6142 (2.60GHz (Turbo: 最大3.70GHz)/22MB 10.4GT/s)×2
Chipset Intel C624
Memory 256GB (32GB×8) DDR4-2666 SDRAM ECC Reg.
HDD (system) 2TB SATA HDD 7,200rpm×2, RAID1構築済み ※MTBF 2.0Mhrs
HDD (data) 264TB (12TB SATA HDD 7,200rpm×22) +予備HDD×1 ※RAID構成はご相談のうえ決定いたします ※MTBF 2.5Mhrs
Network 10GBase-T×2, IPMI
Chassis & PSU 19" 4U rackmount, 1280W redundant (80PLUS Platinum)
OS/設定 Cent OS for x86_64, MPI構築済み, Univa Grid Engine構築済み
Cluster compute node(1台)<4ワークノード/台> ※2
CPU {Intel 16-core Xeon Gold 6142 (2.60GHz (Turbo: 最大3.70GHz)/22MB 10.4GT/s)×2}×4
Chipset {Intel C621}×4
Memory {256GB (32GB×8) DDR4-2666 SDRAM ECC Reg.}×4
HDD {2TB SATA HDD 7,200rpm×1}×4 ※MTBF 2.0Mhrs
Network {10GBase-T×2, IPMI}×4
Chassis & PSU 19" 2U rackmount, 2200W redundant (80PLUS Titanium)
OS/設定 Cent OS for x86_64, MPI構築済み, Univa Grid Engine構築済み
Network switch (10-Gigabit Ethernet)(1台) ※3
Port 10GBase-T×14, 10G-SFP+×2
1U rackmount, LANケーブル付属(必要数)
KVMドロワー&スイッチ(1台)
17" TFT rackmount LED、入力デバイス付き, 16-KVM port, KVMケーブル付属(必要数)
UPS(1台)
全システムバックアップ分, AC200V入力, 常時インバーター方式
停電時自動シャットダウン機能付き
PDU(1台)
Input: 200V30A (NEMA L6-30P), Output: IEC320 C13(12), 1U rackmount
ラック(1本)
19" 36U(EIA1750H600W1100D)両側面パネル(コインキー仕様)および前後扉付き
転倒防止スタビライザーおよびレベルキャスター付属
動作確認
搬入/設置/動作確認作業含む
保証・保守
ハードウエア3年保証、システムオンサイト保守(納入後1年間)※(年20時間以内のTakeru Project-Lifetime Supportを含む)
  • ※1 Dockerのprivate registryを構築しています。
  • ※2 1台に4ワークノードを含むシステムです。1台の場合、CPUコア数合計は16-core (16)×dual (2)×4ワークノード×1台=128個となります。
  • ※3 InfiniBandへの変更も可能です。

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