次世代シーケンサーデータ解析エントリーサーバー
高速シーケンサーの生み出す膨大なデータを解析するために初めて導入するサーバーとして最適なシステム、それがTakeru Lite for Sequencer IVです。BWA、Bowtie、GATK、Samtools、Picard、snpeff、Cufflinks、TopHat、FastQC、fastx-toolkit等エクソーム解析に、またQiime等メタゲノム解析に標準的なソフトウェアが事前インストール済み、構築済みであるため、Takeru Lite for Sequencer IVを導入後すぐに解析を開始できます(その他も含めたTakeru標準構築済みNGSソフトウェアリスト)。机の脇に置けるサイズかつ居室内における騒音を小さく抑えるハードウェアを採用する一方、合計20CPUコア以上、128GBメモリの標準仕様により1台でも十分に計算力を発揮できます。
Takeru Lite for Sequencer IVは、さまざまな視点からシステムを拡張することが可能です。ゲノムアセンブリ等でメモリ容量は欲しいがサーバーラック設置場所がないという場合、最大で1.5TBまでメモリ空間を確保できます。また、サーバー自体の増設により、既存サーバーとデータを共有させたり、ネットワークスイッチを追加して並行計算可能なクラスターシステムを構築したりと、CPU数を増やせます。ストレージについては、Takeru Lite for Sequencer IV-wideに含まれる2台の拡張ディスクサブシステム合計128TBのディスクが、解析最中のアクセス頻度が高いデータを保存する場所となります。その他、例えば解析完了後データや参照先データベースを簡易的に置いておく数十テラバイト超のNAS型ディスクを追加し、ストレージを拡張することも可能です。
ChIP-seq、RNA-seq、メタゲノム解析等に使用したいNGS解析ソフトウェア群を構築済みで導入できる点が、Takeru Lite for Sequencer IVの特長です。Galaxy等のウェブベースツールをローカル環境に構築する、ユーザーの予算プロジェクト期間中を通して新規アプリケーションを追加で設定する等も可能なため、多様なデータ解析手法を追及できます(詳しくはこちら)。また、ハードウェアとソフトウェア動作を合わせてのワンストップサポート(Takeru Project-Lifetime Supportの詳細はこちら)が含まれているため、構築したソフトウェアの動作を含めたシステム全体に対してサポートを得られます。その他、共同研究先や出張先からの遠隔アクセス、シーケンサー設置場所と研究室が離れている場合のネットワーク等設定など、解析サーバー周りのIT環境整備(詳しくはこちら)が可能です。
Server | |
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CPU | Intel Xeon Gold 61xx or 51xx ×2 |
Chipset | Intel C620 Series |
Memory | 128GB(16GB×8)DDR4-2666 SDRAM ECC Reg. |
HDD (system) | 2TB SATA HDD 7,200rpm×2 ※RAID1構築済み ※MTBF 2.0Mhrs |
Graphics | NVIDIA Quadro P600 |
HDD (data) | 4TB SATA HDD 7,200rpm×6+予備HDD×1 ※MTBF 2.0Mhrs ※RAID構成は別途ご相談の上決定いたします |
Network | 1000BASE-T×2, LANケーブル |
Chassis | 19" 4U rackmountable tower, 1200W(80 PLUS Platinum), low-noise |
OS/設定 | CentOS for x86_64, MPI構築済み |
付属品 | Keyboard, Mouse |
その他 | |
UPS(停電時自動シャットダウン設定済み) | |
搬入/設置/動作確認含む | |
システムオンサイト保守(納入後1年間)含む(※年10時間以内のTakeru Project-Lifetime Support含む) ※ハードウエア保証:3年 | |
構築するバイオインフォマティクスソフトウェアはご相談のうえ決定いたします |
Server | |
---|---|
CPU | Intel Xeon Gold 61xx or 51xx ×2 |
Chipset | Intel C620 Series |
Memory | 128GB(16GB×8)DDR4-2666 SDRAM ECC Reg. |
HDD (system) | 2TB SATA HDD 7,200rpm×2+予備HDD×1 ※RAID1構築済み ※MTBF 2.0Mhrs |
Graphics | NVIDIA Quadro P600 |
Network | 1000BASE-T×2, LANケーブル |
Chassis | 19" 4U rackmountable tower, 1200W(80 PLUS Platinum), low-noise |
OS/設定 | CentOS for x86_64構築済み |
付属品 | Keyboard, Mouse |
拡張ディスクサブシステム(2台) | |
Host | 12Gb/s SAS host interface |
HDD | 8TB SATA HDD 7,200rpm×8+予備HDD(サブシステム1台のみに付属)×1 ※MTBF 2.0Mhrs |
Chassis | desktop tower JBOD 8-Bay enclosure 220W×2 |
設定 | ServerとのRAID接続動作確認 |
その他 | |
UPS(停電時自動シャットダウン設定済み) | |
搬入/設置/動作確認含む | |
システムオンサイト保守(納入後1年間)含む(※年10時間以内のTakeru Project-Lifetime Support含む) ※ハードウエア保証:3年 | |
構築するバイオインフォマティクスソフトウェアはご相談のうえ決定いたします |
構成や仕様に関する変更ご希望等についてはお問い合わせください。